Михайлівський скельний монастир у Бакоті розташований у мальовничій місцевості, звідки відкриваються розкішні панорами на Дністер і Подільські Товтри.
Бакота у перекладі з давньоруської мови означає бажане, прекрасне місце. Знаходиться воно на березі Дністра - на території Національного природного парку «Подільські Товтри».
Бакота - стародавня столиця «Русі Дольної» - так називали у XIII-XIV ст. територію між Дністром і Південним Бугом, яка у XIII ст. входила до складу Галицько-Волинського князівства. Галицько-Волинський літопис відзначає, що в епоху Київської Русі Бакота була важливим торговим портом на Дністрі.
Неподалік Бакоти над Дністром височить Біла гора, де ще у XII-XIII ст. на місці язичницького капища виник найдавніший печерний монастир Подільської землі - це і є Бакітський скельний монастир. Узвишшя «Біла гора» утворене твердими силурійськими вапняками, в яких Дністер прорізав каньйон глибиною до 120 м.